Optimize Two Sequences DNA

Ini adalah program untuk mencari optimasi dua sekuens DNA.
Langkah-langkahnya:

1. Inputkan sekuens yang akan dioptimasi pada kolom A dan B. Contoh input:aacgttc.
2. Inputkan nilai pada kolom match (untuk segmen yang cocok), mismatch (untuk segmen yang tidak cocok), dan D (untuk distance).
3. Pilih metode yang digunakan. Tersedia pilihan Smith Waterman, Needleman Wunsch, dan Affine Gap.
4. Oke, muncullah hasil optimasi sekuens pada A' dan B'.

Silahkan mencoba.

OPTIMUM ALIGNMENT
A =       Smith Waterman
B =       Needleman Wunsch
Match :   Mismatch :            D :                 Affine Gap

Optimum Sequence
A' =
B' =

Tabel M(i,j)

Tabel Ix

Tabel Iy